Programme pédagogique

PROGRAMME GLOBAL EDR MASTER RECHERCHE 2 INFECTIOLOGIE TROPICALE (FRANCEVILLE-GABON )

TRONC COMMUN

UNITE 1 : MICROBIOLOGIE GENERALE ET RAPPEL SUR LES AGENTS INFECTIEUX   

Module 1: Caractérisation d'un agent pathogène BACTERIO II - Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome
VIROLOGIE II - Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome
PARASITO/MYCO II -Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome
Module 2: Immunologie, Biologie cellulaire et Physiopathologie Immunologie générale appliquée à l'infectiologie: Réponse de l'hôte
Biologie cellulaire et physiopathologie
Module 3: Aspects émergents en pathologies humaines Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. hemorragiques
Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. neurologiques
Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. fébriles
Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. diarrhéiques
Module 4: Microbiote Microorganismes pathogènes et microbiote    
Module 5: Base en génétique Base en génétique      
           
CONF THEME Problèmes émergents en Parasitologie/mycologie
CONF LIBRE Echappement parasitaire
CONF/THEM Dissémination virale de cellule à cellule
CONF LIBRE Apoptose et nécrose
CONF LIBRE Agression tissulaire par les agents pathogènes
           
EDTP LE DIAGNOSTIC VIRAL
TP ENSEMENCEMENT DES BACTERIES EN MILIEUX LIQUIDES ET SUR GELOSE
TP IDENTIFICATION BACTERIENNE A L'AIDE DE GALERIES API
TP DIAGNOSTIC DIRECT DU PALUDISME
TP DIAGNOSTIC MOLECULAIRE D'UNE PARASITOSE : LA TOXOPLASMOSE

 

UNITE 2 : METHODES EN EPIDEMIOLOGIE et SANTE PUBLIQUE

Module 1 Introduction à l'épidémiologie/Indicateurs en santé publique (outils de mesure, démographie, morbidité, mortalité, autres): cours
Problèmes communs aux enquêtes en épidémiologie (dont les biais)/Causalité et mesure d'impact : cours
Différents types d'enquètes en épidémiologie (descriptive, analytique, évaluative)/Surveillance épidémiologique: TD
Echantillonnage dans les enquètes en épidémiologie: TD
Protocole d'enquète (rédaction de protocole, élaboration de questionnaire): TD
Travail de groupe sur des articles "interêts et limites des données statistiques" (en anglais et français): TD
Qualités diagnostiques des tests: TD
Module 2 Base en Biostatistique: Enquètes épidémiologiques et gestion des données (eléments de biostatistique, présentation des données,standardisation) 
Logiciels d'analyse statistique: Mise en niveau en R    
   
CONF THEME Approche "Phylip" et approche progressive (application à un modèle viral)
CONF THEME Géomatique de la Santé (Télédédection) appliquée à l'environnement équatorial
CONF THEME Santé publique et Infectiologie : Qualité de l'eau de boisson et des aliments
CONF THEME Santé publique et Infectiologie : infections nosocomiales
CONF LIBRE Santé publique et Infectiologie : lutte contre les anthropozoonoses:exemple de la fièvre aphteuse
CONF LIBRE Santé publique et Infectiologie : la tuberculose au XXI ième siècle

 

 UNITE 3 : PHARMACOGENETIQUE ET MEDICAMENTS

Module 1 Place des anti-infectieux, antiseptiques, désinfectants: définitions, mécanismes d'action, prescription    
Pharmacopée tropicale: les plantes médicinales    
Ecologie et systématique des plantes médicinales    
Accés aux soins et médicaments en PED
Module 2 Pharmacocinétique; pharmacodynamie (PK, PD, Cmax, ASC, demi-vie, Emax,PAE, PASME)     
Identification des nouvelles cibles théraupeutiques    
Pharmacogénétique      
Développement préclinique et clinique des médicaments: Tests pré cliniques, expérimentation animale, essais cliniques (phase I-IV)  
   
CONF/TH  De l'idée de médicament à sa génèse: recherche exploratoire, identification de la cible, screening in vitro
CONF/TH  Procédure administrative et commissions du médicament (AMM, EMEA, ASMR)
CONF/TH  Noyau ferrocène et ferroquine : nouvelle approche curative du paludisme humain
CONF LIBRE Toxicologie et pharmacovigilance
CONF LIBRE Bonnes pratiques de fabrication et contrefaçon
   
EDTP EXTRAITS BRUTS DE PLANTES MEDICINALES: preparation, fractionnements
EDTP TESTS D'ACTIVITE DES EXTRAITS BRUTS SUR DES SOUCHES BACTERIENNES ET ISOLATS RESISTANTS

 

UNITE 4 : PROGRAMMES DE CONTRÔLE DES GRANDES ENDEMIES EQUATORIALES ET OUTILS DIAGNOSTIQUES D'EVALUATION ET DE CONTRÔLE DU MALADE ET DE LA MALADIE

Module 1 La démarche diagnostique de recherche directe et indirecte qualitative et quantitative de l'agent pathogène
Méthodologies dans la prise en charge du Paludisme:du moustique au vaccin en passant par la chimie
La Lutte antivectorielle appliquées aux endémies humaines
Stratégies de lutte contre les arboviroses
Module 2 Biosurété et Biosécurité: Le laboratoire de biologie : niveaux d'efficacité, contrôle qualité,…
           
CONF LIBRE La bio-mol outil d'étude de l'hybridation naturelle d'espèces bilharziennes d'Afrique équatoriale
CONF LIBRE L'hyperéosinophilie sanguine et tissulaire: marqueurs diagnostique et physiopathologique des parasitoses
CONF/TH  Objectifs du Millenium (UN)  et Pludisme : évaluation et contrôle de la morbi-mortalité
CONF/TH  Programmes internationaux de lutte contre les grandes endémies: exemple des filarioses humaines
CONF LIBRE Santé publique et Infectiologie : Réseaux /sentinelles,surveillance des émergences virales
CONF LIBRE Politique de Santé systèmes nationaux et internationaux de prévention
CONF LIBRE Priorités et risques en Santé : DCCP (DISEASES Control Priorities Project)
CONF THEME PPP (partenariat public-privé)/multi sites: exemple d'une décennie de lutte contre le SIDA
CONF/TH  Le Programme Elargi des Vaccinations (PEV)
CONF/TH  Système de Surveillance Syndromique des maladies à potentiel épidémique en temps réel
CONF/TH  Santé et Développement : à propos de la lutte contre les nématodoses intestinales
           
ED/TP PROJET DE LUTTE CONTRE UNE ENDEMIE: objectifs, méthodologie, rédaction
ED Tests rapides en bactéri-viro-parasitologie:  interêts et limites
ED Diagnostics en bactério-viro-parasito (direct-indirect-spécifique-aspécifique)
TP  TESTS DE DIAGNOSTIC HIV, HVB
TP DETERMINATION DE LA CHARGE VIRALE
TP PCR EN TEMPS REEL : DETERMINATION DU NOMBRE DE COPIES D'ARN…..

 

 UNITE 5 : FORMATION A LA REDACTION SCIENTIFIQUE, LA BIBLIOGRAPHIE ET LA PRESENTATION ORALE

Module 1: Communication scientifique Règles et structure d'une communication scientifique    
Enjeux (éthique, pertinence, exclusivité, originalité); formes, processus et exigences de la communication scientifique    
Normes de publication dans les revues scientifiques: Objectifs, structure et style d'un article scientifique    
Stratégies et outils utiles à la production d'une communication orale    
Vulgarisation scientifique et critique constructive.        
Comment preparer et presenter un mémoire
           
ED/TP Recherches bibliographiques : Bases de données
ED/TP Lectures critiques d'articles en français et en anglais
ED/TP REDACTION ET ANALYSE D'ARTICLES DE PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES
ED/TP REDACTION DE PROTOCOLE SCIENTIFIQUE
           
CONF/TH La présentation orale
SEMINAIRE Séminaire sur la rédaction scientifique

 

 

EPER (Environnement, Pathologies Emmergentes et Ré-émergents) ESBM(Epidémiologie et Surveillance des Biomarqueurs)
UNITE 1.1: ASPECTS EMERGENTS ET REEMERGENTS EN PATHOLOGIES HUMAINES UNITE 1 : EPIDEMIOLOGIE EN SANTE PUBLIQUE
Module 1 Emergences et Ré-émergences épidémiologiques, biocliniques et thérapeutiques  Module 1 Environnement tropical et Santé
Biologie moléculaire des agents infectieux et nvx pathogènes: Etude et caractérisation des agents infectieux émergents Ivermectine en thérapeutique chez l'homme: la polyvalence avantages et limites
Les micromycètes dans l'environnement tropical:mycoses superficielles et profondes CONF/TH Vaccinologie en bactèriologie : nouvelles approches
    CONF LIBRE L'épidémie d'E.coli hémorragique,uricémique en 2011 : que craindre ?
UNITE 1.2  : PATHOGENES EMEGENTS: ENVIRONNEMENT, TRANSMISSION, PHYLOGENOMIQUE CONF/TH Vaccinologie en VIROLOGIE : nouvelles approches
 Module 1 Virus hémorragiques: Environnement, Relation inter-espèces, phylogénie (EBOLA, Marburg, Fièvre de la vallée du Rif,,,) CONF LIBRE Vaccininologie en parasitologie : paludisme, toxoplasmose….
Module 2 Virus respiratoires: Environnement, Relation inter-espèces, phylogénie (MERS, SARS-CoV, Grippe) CONF LIBRE Problèmatique de la co-infection
Module 3 Entomologie médicale et maladies émergentes CONF LIBRE Impact épidémi-physiologique de la biodiversité des fongiques et parasitaires

 

UNITE 1.3 : PATHOGENES RE-EMEGENTS
  Rougeole: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence
  TB: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence
  Poliomyelite: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence
  Monkey pox: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence
  Fièvre jaune: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence
  Variole: exemple d'éradication    
CONF LIBRE Relations entre les plasmodies des grands singes et l'homme
  Transmission interespèces des spumavirus au Gabon
CONF/TH Virus et environnement tropical
CONF/TH Rôle des recombinants , diversité et émergences
CONF/TH immunologie des maladies virales aigues
CONF/ED Biologie moléculaire : application à l'épidémiologie et surveillance des agents infectieux et nvx pathogènes
CONF THEME Environnement tropical,parasites et parasitoses I : parasites, réservoirs, hôtes intermédiaires, transmission, hôte définitif
CONF THEME Environnement tropical, parasites et parasitoses  II : Les cycles:apports en diagnostic, bio-clinique et thérapeutique
CONF THEME Entomologie médicale sous les tropiques: le cas du paludisme et des trypanosomoses
CONF THEME Anthropozoonoses impliquées en infectiologie humaine: réservoirs de parasites, préventions
CONF THEME Environnement forestier:implications dans la transmissiondes parasitoses, rôle du réchauffement planet.
CONF/TH Le point sur les émergences virales : épidémies récentes    

 

UNITE 2 : RESISTANCES AUX ANTIMICROBIENS
COURS Interactions Hôte-parasite : physiopathologie
COURS Interactions Hôte-Bactérie : diversité des mécanismes de virulence et physiopathologie
COURS Intéractions Hôte-Virus : virulence et pathogènicité
COURS Génotype et determinisme virologique prédictifs de la réponse au traitement du virus de l'hépatite C
Cours VIH et résistances aux anti retroviraux: Etude des molécules nouvelles et anciennes, mécanismes de résistance, notions de réservoirs
COURS Résistances et nouvelles stratégies thérapeutiques : le paludisme
COURS Résistances aux antiviraux : mécanismes et conséquences
COURS Antibiotiques : mécanismes d'actions et Résistances 
CONF LIBRE Multirésistances aux antibiotiques dans le monde ( phénicolés, béta-laéctamases: classificationet évolution)
CONF LIBRE Résistances aux quinolones : mécanismes génétiques et biochimiques
CONF/TH  RESISTANCES DES PLASMODIES: Artémisinines et résistances des  hémtozoaïres
CONF/TH  Résistances des mycobactéries aux thérapeutiques
VIDEOFILM VIH et Cibles antivirales
CONF LIBRE Facteurs impliqués dans la virulence : exemple des Brucella (mutagénèse,étiquettes (STM))
CONF/TH  Génotypes et déterminisme virologique prédictifs de la réponse au traitement du Virus de l'Hepatite C
CONF LIBRE Virus de l'hépatite C : résistances et évolution des prises en charge
CONF LIBRE Mécanismes d'actions des antiviraux
EDTP GENOTYPAGE DE PLASMODIUM FALCIPARUM (marqueurs MSPM1/2, EBA-175)
EDTP GENOTYPAGE DE TOXOPLASMES
ED CARACTERISATION MOLECULAIRE DE CANDIDA ALBICANS
EDTP L'ANTIBIGRAMME
EDTP DETERMINATION D'UNE CONCENTRATION MINIMALE INHIBITRICE (CMI)(IC50)

 

UNITE 3 : BIOMARQUEURS
COURS VIH/SIDA : Définition, clinique, diagnostic, suivi et traitement
COURS Les opportunistes en clinique humaines: parasites et champignons
COURS Relation hôte-virus: génomique et physiopathologie
   
CONF THEME Les cibles de la thérapeutique au cours du cycle de l'hématozoaire
CONF LIBRE Anémies parasitaires et complexe pathogène tropical, cumul des maladies
CONF LIBRE Parasites et cancers
CONF LIBRE Pneumocystis : le développement de modèles expérimentaux
   
CONF LIBRE Bases moléculaires du pouvoir pathogène : à propos des streptocoques
CONF LIBRE Les biofilms
CONF LIBRE Transmission vectorielle des bactèrioses: exemple de  l'Ulcère de Buruli
CONF LIBRE Hépatite C : diversité 
CONF LIBRE Agents viraux et cancers
CONF LIBRE HIV : diversité et échappement
CONF LIBRE Biologie moléculaire  appliquée à la loaose
   
EDTP ENSEMENCEMENT ET CULTURE DE LIGNEE  CELLULAIRE (MRC5, VERO, ….)
TP INFECTION DE LIGNEE CELLULAIRE PAR UN VIRUS CMV, DETERMINATION DE L'EFFET CYTOPATHOGENE

 

UNITE 4: SURVEILLANCE DES MICROORGANISMES PATHOGENES
COURS virologie: épidémiologie et prise en charge
   
CONF/TH Hépatite B : Diagnostic et traitement
CONF/TH Hépatite B : Diagnostic et traitement
CONF LIBRE Plasmodies : séquençage, génotypage ( application à la surveillance du paludisme humain)
CONF/TH  Stratégies de lutte contre les résistances aux thérapeutiques

 


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