PROGRAMME GLOBAL EDR MASTER RECHERCHE 2 INFECTIOLOGIE TROPICALE (FRANCEVILLE-GABON )
TRONC COMMUN
UNITE 1 : MICROBIOLOGIE GENERALE ET RAPPEL SUR LES AGENTS INFECTIEUX
| Module 1: Caractérisation d'un agent pathogène | BACTERIO II - Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome | ||||
| VIROLOGIE II - Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome | |||||
| PARASITO/MYCO II -Agents infectieux: notions d'espèce, génétique, génome, protéome | |||||
| Module 2: Immunologie, Biologie cellulaire et Physiopathologie | Immunologie générale appliquée à l'infectiologie: Réponse de l'hôte | ||||
| Biologie cellulaire et physiopathologie | |||||
| Module 3: Aspects émergents en pathologies humaines | Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. hemorragiques | ||||
| Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. neurologiques | |||||
| Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. fébriles | |||||
| Infectiologie et syndrômes (étiologies, physiopathologie): S. diarrhéiques | |||||
| Module 4: Microbiote | Microorganismes pathogènes et microbiote | ||||
| Module 5: Base en génétique | Base en génétique | ||||
| CONF THEME | Problèmes émergents en Parasitologie/mycologie | ||||
| CONF LIBRE | Echappement parasitaire | ||||
| CONF/THEM | Dissémination virale de cellule à cellule | ||||
| CONF LIBRE | Apoptose et nécrose | ||||
| CONF LIBRE | Agression tissulaire par les agents pathogènes | ||||
| EDTP | LE DIAGNOSTIC VIRAL | ||||
| TP | ENSEMENCEMENT DES BACTERIES EN MILIEUX LIQUIDES ET SUR GELOSE | ||||
| TP | IDENTIFICATION BACTERIENNE A L'AIDE DE GALERIES API | ||||
| TP | DIAGNOSTIC DIRECT DU PALUDISME | ||||
| TP | DIAGNOSTIC MOLECULAIRE D'UNE PARASITOSE : LA TOXOPLASMOSE | ||||
UNITE 2 : METHODES EN EPIDEMIOLOGIE et SANTE PUBLIQUE
| Module 1 | Introduction à l'épidémiologie/Indicateurs en santé publique (outils de mesure, démographie, morbidité, mortalité, autres): cours | ||||
| Problèmes communs aux enquêtes en épidémiologie (dont les biais)/Causalité et mesure d'impact : cours | |||||
| Différents types d'enquètes en épidémiologie (descriptive, analytique, évaluative)/Surveillance épidémiologique: TD | |||||
| Echantillonnage dans les enquètes en épidémiologie: TD | |||||
| Protocole d'enquète (rédaction de protocole, élaboration de questionnaire): TD | |||||
| Travail de groupe sur des articles "interêts et limites des données statistiques" (en anglais et français): TD | |||||
| Qualités diagnostiques des tests: TD | |||||
| Module 2 | Base en Biostatistique: Enquètes épidémiologiques et gestion des données (eléments de biostatistique, présentation des données,standardisation) | ||||
| Logiciels d'analyse statistique: Mise en niveau en R | |||||
| CONF THEME | Approche "Phylip" et approche progressive (application à un modèle viral) | ||||
| CONF THEME | Géomatique de la Santé (Télédédection) appliquée à l'environnement équatorial | ||||
| CONF THEME | Santé publique et Infectiologie : Qualité de l'eau de boisson et des aliments | ||||
| CONF THEME | Santé publique et Infectiologie : infections nosocomiales | ||||
| CONF LIBRE | Santé publique et Infectiologie : lutte contre les anthropozoonoses:exemple de la fièvre aphteuse | ||||
| CONF LIBRE | Santé publique et Infectiologie : la tuberculose au XXI ième siècle | ||||
UNITE 3 : PHARMACOGENETIQUE ET MEDICAMENTS
| Module 1 | Place des anti-infectieux, antiseptiques, désinfectants: définitions, mécanismes d'action, prescription | ||||
| Pharmacopée tropicale: les plantes médicinales | |||||
| Ecologie et systématique des plantes médicinales | |||||
| Accés aux soins et médicaments en PED | |||||
| Module 2 | Pharmacocinétique; pharmacodynamie (PK, PD, Cmax, ASC, demi-vie, Emax,PAE, PASME) | ||||
| Identification des nouvelles cibles théraupeutiques | |||||
| Pharmacogénétique | |||||
| Développement préclinique et clinique des médicaments: Tests pré cliniques, expérimentation animale, essais cliniques (phase I-IV) | |||||
| CONF/TH | De l'idée de médicament à sa génèse: recherche exploratoire, identification de la cible, screening in vitro | ||||
| CONF/TH | Procédure administrative et commissions du médicament (AMM, EMEA, ASMR) | ||||
| CONF/TH | Noyau ferrocène et ferroquine : nouvelle approche curative du paludisme humain | ||||
| CONF LIBRE | Toxicologie et pharmacovigilance | ||||
| CONF LIBRE | Bonnes pratiques de fabrication et contrefaçon | ||||
| EDTP | EXTRAITS BRUTS DE PLANTES MEDICINALES: preparation, fractionnements | ||||
| EDTP | TESTS D'ACTIVITE DES EXTRAITS BRUTS SUR DES SOUCHES BACTERIENNES ET ISOLATS RESISTANTS | ||||
UNITE 4 : PROGRAMMES DE CONTRÔLE DES GRANDES ENDEMIES EQUATORIALES ET OUTILS DIAGNOSTIQUES D'EVALUATION ET DE CONTRÔLE DU MALADE ET DE LA MALADIE
| Module 1 | La démarche diagnostique de recherche directe et indirecte qualitative et quantitative de l'agent pathogène | ||||
| Méthodologies dans la prise en charge du Paludisme:du moustique au vaccin en passant par la chimie | |||||
| La Lutte antivectorielle appliquées aux endémies humaines | |||||
| Stratégies de lutte contre les arboviroses | |||||
| Module 2 | Biosurété et Biosécurité: Le laboratoire de biologie : niveaux d'efficacité, contrôle qualité,… | ||||
| CONF LIBRE | La bio-mol outil d'étude de l'hybridation naturelle d'espèces bilharziennes d'Afrique équatoriale | ||||
| CONF LIBRE | L'hyperéosinophilie sanguine et tissulaire: marqueurs diagnostique et physiopathologique des parasitoses | ||||
| CONF/TH | Objectifs du Millenium (UN) et Pludisme : évaluation et contrôle de la morbi-mortalité | ||||
| CONF/TH | Programmes internationaux de lutte contre les grandes endémies: exemple des filarioses humaines | ||||
| CONF LIBRE | Santé publique et Infectiologie : Réseaux /sentinelles,surveillance des émergences virales | ||||
| CONF LIBRE | Politique de Santé systèmes nationaux et internationaux de prévention | ||||
| CONF LIBRE | Priorités et risques en Santé : DCCP (DISEASES Control Priorities Project) | ||||
| CONF THEME | PPP (partenariat public-privé)/multi sites: exemple d'une décennie de lutte contre le SIDA | ||||
| CONF/TH | Le Programme Elargi des Vaccinations (PEV) | ||||
| CONF/TH | Système de Surveillance Syndromique des maladies à potentiel épidémique en temps réel | ||||
| CONF/TH | Santé et Développement : à propos de la lutte contre les nématodoses intestinales | ||||
| ED/TP | PROJET DE LUTTE CONTRE UNE ENDEMIE: objectifs, méthodologie, rédaction | ||||
| ED | Tests rapides en bactéri-viro-parasitologie: interêts et limites | ||||
| ED | Diagnostics en bactério-viro-parasito (direct-indirect-spécifique-aspécifique) | ||||
| TP | TESTS DE DIAGNOSTIC HIV, HVB | ||||
| TP | DETERMINATION DE LA CHARGE VIRALE | ||||
| TP | PCR EN TEMPS REEL : DETERMINATION DU NOMBRE DE COPIES D'ARN….. | ||||
UNITE 5 : FORMATION A LA REDACTION SCIENTIFIQUE, LA BIBLIOGRAPHIE ET LA PRESENTATION ORALE
| Module 1: Communication scientifique | Règles et structure d'une communication scientifique | ||||
| Enjeux (éthique, pertinence, exclusivité, originalité); formes, processus et exigences de la communication scientifique | |||||
| Normes de publication dans les revues scientifiques: Objectifs, structure et style d'un article scientifique | |||||
| Stratégies et outils utiles à la production d'une communication orale | |||||
| Vulgarisation scientifique et critique constructive. | |||||
| Comment preparer et presenter un mémoire | |||||
| ED/TP | Recherches bibliographiques : Bases de données | ||||
| ED/TP | Lectures critiques d'articles en français et en anglais | ||||
| ED/TP | REDACTION ET ANALYSE D'ARTICLES DE PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES | ||||
| ED/TP | REDACTION DE PROTOCOLE SCIENTIFIQUE | ||||
| CONF/TH | La présentation orale | ||||
| SEMINAIRE | Séminaire sur la rédaction scientifique | ||||
| EPER (Environnement, Pathologies Emmergentes et Ré-émergents) | ESBM(Epidémiologie et Surveillance des Biomarqueurs) | ||||
| UNITE 1.1: ASPECTS EMERGENTS ET REEMERGENTS EN PATHOLOGIES HUMAINES | UNITE 1 : EPIDEMIOLOGIE EN SANTE PUBLIQUE | ||||
| Module 1 | Emergences et Ré-émergences épidémiologiques, biocliniques et thérapeutiques | Module 1 | Environnement tropical et Santé | ||
| Biologie moléculaire des agents infectieux et nvx pathogènes: Etude et caractérisation des agents infectieux émergents | Ivermectine en thérapeutique chez l'homme: la polyvalence avantages et limites | ||||
| Les micromycètes dans l'environnement tropical:mycoses superficielles et profondes | CONF/TH | Vaccinologie en bactèriologie : nouvelles approches | |||
| CONF LIBRE | L'épidémie d'E.coli hémorragique,uricémique en 2011 : que craindre ? | ||||
| UNITE 1.2 : PATHOGENES EMEGENTS: ENVIRONNEMENT, TRANSMISSION, PHYLOGENOMIQUE | CONF/TH | Vaccinologie en VIROLOGIE : nouvelles approches | |||
| Module 1 | Virus hémorragiques: Environnement, Relation inter-espèces, phylogénie (EBOLA, Marburg, Fièvre de la vallée du Rif,,,) | CONF LIBRE | Vaccininologie en parasitologie : paludisme, toxoplasmose…. | ||
| Module 2 | Virus respiratoires: Environnement, Relation inter-espèces, phylogénie (MERS, SARS-CoV, Grippe) | CONF LIBRE | Problèmatique de la co-infection | ||
| Module 3 | Entomologie médicale et maladies émergentes | CONF LIBRE | Impact épidémi-physiologique de la biodiversité des fongiques et parasitaires | ||
| UNITE 1.3 : PATHOGENES RE-EMEGENTS | |||
| Rougeole: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence | |||
| TB: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence | |||
| Poliomyelite: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence | |||
| Monkey pox: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence | |||
| Fièvre jaune: Agent pathogène, Epidémiologie, Physiopathologie, Facteurs de ré-émergence | |||
| Variole: exemple d'éradication | |||
| CONF LIBRE | Relations entre les plasmodies des grands singes et l'homme | ||
| Transmission interespèces des spumavirus au Gabon | |||
| CONF/TH | Virus et environnement tropical | ||
| CONF/TH | Rôle des recombinants , diversité et émergences | ||
| CONF/TH | immunologie des maladies virales aigues | ||
| CONF/ED | Biologie moléculaire : application à l'épidémiologie et surveillance des agents infectieux et nvx pathogènes | ||
| CONF THEME | Environnement tropical,parasites et parasitoses I : parasites, réservoirs, hôtes intermédiaires, transmission, hôte définitif | ||
| CONF THEME | Environnement tropical, parasites et parasitoses II : Les cycles:apports en diagnostic, bio-clinique et thérapeutique | ||
| CONF THEME | Entomologie médicale sous les tropiques: le cas du paludisme et des trypanosomoses | ||
| CONF THEME | Anthropozoonoses impliquées en infectiologie humaine: réservoirs de parasites, préventions | ||
| CONF THEME | Environnement forestier:implications dans la transmissiondes parasitoses, rôle du réchauffement planet. | ||
| CONF/TH | Le point sur les émergences virales : épidémies récentes | ||
| UNITE 2 : RESISTANCES AUX ANTIMICROBIENS | |
| COURS | Interactions Hôte-parasite : physiopathologie |
| COURS | Interactions Hôte-Bactérie : diversité des mécanismes de virulence et physiopathologie |
| COURS | Intéractions Hôte-Virus : virulence et pathogènicité |
| COURS | Génotype et determinisme virologique prédictifs de la réponse au traitement du virus de l'hépatite C |
| Cours | VIH et résistances aux anti retroviraux: Etude des molécules nouvelles et anciennes, mécanismes de résistance, notions de réservoirs |
| COURS | Résistances et nouvelles stratégies thérapeutiques : le paludisme |
| COURS | Résistances aux antiviraux : mécanismes et conséquences |
| COURS | Antibiotiques : mécanismes d'actions et Résistances |
| CONF LIBRE | Multirésistances aux antibiotiques dans le monde ( phénicolés, béta-laéctamases: classificationet évolution) |
| CONF LIBRE | Résistances aux quinolones : mécanismes génétiques et biochimiques |
| CONF/TH | RESISTANCES DES PLASMODIES: Artémisinines et résistances des hémtozoaïres |
| CONF/TH | Résistances des mycobactéries aux thérapeutiques |
| VIDEOFILM | VIH et Cibles antivirales |
| CONF LIBRE | Facteurs impliqués dans la virulence : exemple des Brucella (mutagénèse,étiquettes (STM)) |
| CONF/TH | Génotypes et déterminisme virologique prédictifs de la réponse au traitement du Virus de l'Hepatite C |
| CONF LIBRE | Virus de l'hépatite C : résistances et évolution des prises en charge |
| CONF LIBRE | Mécanismes d'actions des antiviraux |
| EDTP | GENOTYPAGE DE PLASMODIUM FALCIPARUM (marqueurs MSPM1/2, EBA-175) |
| EDTP | GENOTYPAGE DE TOXOPLASMES |
| ED | CARACTERISATION MOLECULAIRE DE CANDIDA ALBICANS |
| EDTP | L'ANTIBIGRAMME |
| EDTP | DETERMINATION D'UNE CONCENTRATION MINIMALE INHIBITRICE (CMI)(IC50) |
| UNITE 3 : BIOMARQUEURS | |
| COURS | VIH/SIDA : Définition, clinique, diagnostic, suivi et traitement |
| COURS | Les opportunistes en clinique humaines: parasites et champignons |
| COURS | Relation hôte-virus: génomique et physiopathologie |
| CONF THEME | Les cibles de la thérapeutique au cours du cycle de l'hématozoaire |
| CONF LIBRE | Anémies parasitaires et complexe pathogène tropical, cumul des maladies |
| CONF LIBRE | Parasites et cancers |
| CONF LIBRE | Pneumocystis : le développement de modèles expérimentaux |
| CONF LIBRE | Bases moléculaires du pouvoir pathogène : à propos des streptocoques |
| CONF LIBRE | Les biofilms |
| CONF LIBRE | Transmission vectorielle des bactèrioses: exemple de l'Ulcère de Buruli |
| CONF LIBRE | Hépatite C : diversité |
| CONF LIBRE | Agents viraux et cancers |
| CONF LIBRE | HIV : diversité et échappement |
| CONF LIBRE | Biologie moléculaire appliquée à la loaose |
| EDTP | ENSEMENCEMENT ET CULTURE DE LIGNEE CELLULAIRE (MRC5, VERO, ….) |
| TP | INFECTION DE LIGNEE CELLULAIRE PAR UN VIRUS CMV, DETERMINATION DE L'EFFET CYTOPATHOGENE |
| UNITE 4: SURVEILLANCE DES MICROORGANISMES PATHOGENES | |
| COURS | virologie: épidémiologie et prise en charge |
| CONF/TH | Hépatite B : Diagnostic et traitement |
| CONF/TH | Hépatite B : Diagnostic et traitement |
| CONF LIBRE | Plasmodies : séquençage, génotypage ( application à la surveillance du paludisme humain) |
| CONF/TH | Stratégies de lutte contre les résistances aux thérapeutiques |